Produkti

Infrasarkanā spektroskopija ir izmantota substrāta-olbaltumvielu mijiedarbības kartēšanai: sarkoplazmatiskā retikuluma Ca(2+)-ATPāzes konformācijas izmaiņas pēc nukleotīdu saistīšanās un ATPāzes fosforilēšanās tika uzraudzītas, izmantojot substrāta ATP un ATP analogus (2'-deoksi-ATP, 3). '-deoksi-ATP un inozīna 5'-trifosfāts), kas tika modificēti noteiktās substrāta funkcionālajās grupās.Adenīna 2'-OH, 3'-OH un aminogrupas modifikācijas samazina saistīšanās izraisīto ATPāzes konformācijas izmaiņu apmēru, īpaši spēcīga ietekme tika novērota pēdējām divām.Tas parāda nukleotīdu-ATPāzes kompleksa strukturālo jutību pret individuālu mijiedarbību starp nukleotīdu un ATPāzi.Visas pētītās grupas ir svarīgas saistīšanai, un noteiktas ligandu grupas mijiedarbība ar ATPāzi ir atkarīga no citu ligandu grupu mijiedarbības.ATPāzes fosforilēšanās tika novērota ITP un 2'-deoksi-ATP, bet ne 3'-deoksi-ATP.Nav tiešas saiknes starp konformācijas izmaiņu apmēru, saistoties ar nukleotīdiem, un fosforilēšanās ātrumu, kas liecina, ka ATP izraisīto konformācijas izmaiņu pilns apjoms fosforilēšanai nav obligāts.Kā novērots nukleotīdu-ATPāzes kompleksam, pirmā fosforilētā ATPāzes starpprodukta E1PCa (2) konformācija ir atkarīga arī no nukleotīda, norādot, ka ATPāzes stāvokļiem ir mazāk vienmērīga konformācija, nekā iepriekš paredzēts.